乾隆年间，俄国沙皇派遣特使来华，明为向皇帝贺寿, 实则包藏祸心，勾结朝廷权臣, 探听中国边防虚实。为了解决此事，朝中各位大臣共商对策，中国军机处大臣福大人亦觉事有蹊跷，派出朝中命臣司马章察探此事。但不料却被对方先下手一步，司马章死于非命。
福大人深感事态严重，立即急召大内乾探朱啸天进见，明查暗访观察动静。因俄人有洋枪, 三百步之内就能致人于死地，朱啸天为此邀请师弟飞刀手高华助阵。高华虽然生性顽劣，胸无大志，但他的飞刀比枪还快,而且还是个神偷。高华有个小兄弟叫小豆子,为人机灵,懂得缩骨功,偷技也高,二人搭档天衣无缝。
俄国特使在中国肆意妄为，欺压中国人，但当地官吏为巴结他们不仅不给予严惩，还举行庆典为俄国特使杜斯托等人压惊。高华和小豆子混入表演队伍，并从俄人身上偷得鼻烟壶一只。朱啸天凭此线索追寻，猜出此物可能是杜斯托与朝内奸臣的交易信物，并不顾生命危险，亲自前往奉天府镇远大将军盛同府邸他以求证实。没想到却被盛同看出来意，招来杀身之祸。
高华遭人偷袭，身受重伤，险些废掉双手，就在千钧一发之际，朱啸天赶了回来，救下师弟，并将其托付给小豆子照料，自己去寻找郎中。没想到，杀手再次找来，小豆子为救病重的高华，多处受伤。高华死里逃生，当朱啸天赶回时，小豆子已气断身亡。二人悲痛万分，誓为小豆子报仇雪恨。
朱啸天明查获奉天府镇远大将军盛同勾结俄人，阴谋夺国，并得知盛同将军和杜斯托将会在次日交换沿海兵力布置图。朱啸天和高华立即前往阻止，双方大打出手，最后终于使奸臣正法，师弟高华壮烈牺牲。
精彩视点：
《神腿铁扇功》的武打场面引人入胜，首要功臣当然还是刘忠良，他干净利落的动作，甚至在第一时间里就勾起人们对黄飞鸿、方世玉、陈真的美好回忆。影片运用了不同的剪辑手法来表现不同场次的武术交战，有效避免了节奏单调可能带来的枯燥感。影片的许多故事情节是在武打场面中同时讲述的，所以在这些场面中，拳脚不仅仅是“打斗”，更是双方无声的“对话”。本片一经上映就大受好评，是一部难得的佳作。